Molecular biology and microbiology

Cette unité d’enseignement (UE) regroupe 2 unités d’apprentissage (AA) :

a) Notion de base de virologie

Bases cellulaires et moléculaires de la réponse antivirale et de la pathogenèse associée à certaines infections virales type (Influenza, HIV, hépatite C, Ebola, HPV)
Utilisation des virus dans la médecine et dans la recherche médicale.
Utilisation de techniques de biologie moléculaire (PCR en temps réel, cytométrie en flux) et cellulaire (culture de virus sur cellules) et des machines correspondantes pour répondre à une question pratique de virologie (TP)

b) Notions approfondies de bactériologie (Dr Anne Botteaux)  

• Théorie (10h: 5x2h)
  • Bases de la biologie moléculaire
    • GENOME
      • ADN Composition - Structure – Propriétés
        Taille du génome – Nombre de chromosomes - Nombre de gènes
        Le génome humain - Types d'ADN génomiques
      • Structure de la chromatine+notions d'épigénétique
      • Réplication de l'ADN
      • Altérations et mutations de l'ADN
    • TRANSCRIPTOME
      • Sous-types d'ARN
      • Transcription
      • Régulation de la transcription (améliorateurs, facteurs de transcription, miARN, ...)
      • Maturation de l'ARNm
      • Epissage (Splicing)
    • PROTEOME
      • Translation
      • Export
      • Modification post-translationnelle…
    • Applications de la biologie moléculaire
      • In vitro
        • Comment modifier l'expression d'un gène dans une cellule ?
          Surexpression (clonage, vecteurs, transitoire vs stable...)
          Régulation à la baisse (siRNA, shRNA, CRISPR)
          Mutation
          Transfection
        • Comment évaluer l'expression des gènes dans une cellule ?
          RT, qPCR classique, en temps-réel, RNA-seq, ChIP-seq, etc.
        • Comment évaluer l'expression des protéines dans une cellule ?
          WB, Protéomique, etc.
      • In vivo
        • Transgenic Mice KnockOuts
          + explication et distribution du projet de groupe
• Applications de la biologie moléculaire - projet de groupe (14h: 7x2h)

Au terme de cet enseignement les étudiants seront capables :

• de faire appel aux notions de virologie acquises afin de comprendre des problèmes virologiques.

• de faire appel aux notions de bactériologie et de comprendre les bases moléculaires des problèmes liés aux contaminations nosocomiales, aux biofilms, à la stérilisation, au développement des matériaux « anti-microbiens» (Dr Anne Botteaux)

• d’interpréter des résultats d’expériences d’analyse virologique types (titrages, qPCR, cytométrie en flux)

• de faire appel aux notions de biologie moléculaire et d'utiliser ces notions afin de comprendre et expliquer les outils, techniques et applications de biologie moléculaire (génie génétique).

• Microbiologie médicale : Cours magistral (24h) et travaux pratiques (12h)

La présence aux travaux pratiques est obligatoire. L'absence aux TP empêchera la validation de l'UE.

• Biologie Moléculaire : cours magistral (10h) et apprentissage par projet (14h)

Contribution au profil d'enseignement

Cette unité d'enseignement contribue aux compétences suivantes :

• Mesurer les grandeurs physico-chimiques liées au vivant, tant morphologique que fonctionnel

• Communiquer efficacement, tant de manière écrite qu’orale, avec des collègues ingénieurs, mais aussi avec les autres acteurs du domaine biomédical et s’intégrer dans une équipe pluridisciplinaire

Références, bibliographie et lectures recommandées

• Microbiologie moléculaire :
  • Virologie : Fields Virology 6th edition, Editors Knipe & Howley, 2013
  • Bactériologie : Prescott’s Microbiology 9th édition, Willey, Sherwood and Woolverton, McGraw-Hill International Edition
     
• Biologie Moléculaire :
  • Molecular Biology of the Cell 6th Edition
  • Molecular Cell Biology 8th Edition

Support(s) de cours

• Université virtuelle

Contacts

Molecular Biology : Rachel DEPLUS
email : rachel.deplus@ulb.be
Molecular microbiology : Anne Op de beeck
Tél.: 02 555 60 81 - e-mail : Anne.op.de.beeck@ulb.be

Campus

Erasme, Solbosch

Méthode(s) d'évaluation

• Examen oral
• Présentation orale
• Travail de groupe

Examen oral

Présentation orale

Travail de groupe

Construction de la note (en ce compris, la pondération des notes partielles)

Si et seulement si les notes de chaque AA sont supérieures ou égales à 10/20, la note finale de l’UE sera la moyenne arithmétique des notes obtenues à chacune des AA, avec la pondération suivante :

• Project defence (30%)
• Knowledge evaluation (70%)

• La note de l'AA de microbiologie moléculaire comportera pour 25% la cote de bactériologie et pour 75% la virologie.

La réussite de l’UE est conditionnée par une note moyenne supérieure ou égale à 10/20.

Si une ou plusieurs note(s) sont inférieures à 10/20, la plus petite note sera attribuée à l’ensemble de l’UE.
Les notes d’AA supérieures ou égales à 10/20 seront automatiquement reportées en seconde session.

En 2nd session, construction de la note identique à la première session.

Report de cote d'une année à l'autre :
Les cotes des activités d'apprentissage au sein d'une UE peuvent être reportées d'une année à l'autre pour autant que ces cotes soient de 10 ou plus et que la moyenne de l'UE fût de 10.
Toutefois ce report n'est possible qu'une seule fois.

Langue(s) d'évaluation

• français
• (éventuellement anglais )