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Bioinformatique
Titulaire(s) du cours
Matthieu DEFRANCE (Coordonnateur) et Maxime TARABICHICrédits ECTS
5
Langue(s) d'enseignement
français
Contenu du cours
Cette unité d'enseignement porte sur les bases de la bioinformatique et présente les principales méthodes et algorithmes. Elle est divisée en 2 parties :
1. Alignement, assemblage et phylogénie
2. Introduction aux technologies de séquençage (NGS). Génomique, transcriptomique et analyse de données
Objectifs (et/ou acquis d'apprentissages spécifiques)
L'objectif de ce cours est de donner aux étudiants une introduction théorique et pratique à la bioinformatique. Les notions d'algorithmes de comparaison de séquences et d'alignements sont présentées. Le langage R est utilisé pour appliquer les notions théoriques à des données biologiques actuelles.
Méthodes d'enseignement et activités d'apprentissages
Cours magistraux et applications.
Références, bibliographie et lectures recommandées
Zvelebil & Baum, "Understanding Bioinformatics", Garland, 2007
Contribution au profil d'enseignement
S'approprier les concepts scientifiques et les connaissances fondamentales de la biochimie, biologie moléculaire et cellulaire et des disciplines connexes (Neurobiologie, Immunologie, Biotechnologies, ...).
Utiliser les ressources bioinformatiques et les logiciels adaptés à leur exploitation.
Développer une argumentation scientifique.
Rédiger un rapport de recherche selon les bonnes pratiques de la BBMC.
Autres renseignements
Contacts
Prof Matthieu Defrance
Département d'Informatique
Université Libre de Bruxelles
Boulevard du Triomphe CP 212
1050 Brussels
Belgium
Tel: 02/650.58.68
Email: mathieu.defrance@ulb.be
Campus
Plaine, Solbosch
Evaluation
Méthode(s) d'évaluation
- Présentation orale
- Rapport écrit
Présentation orale
Rapport écrit
Construction de la note (en ce compris, la pondération des notes partielles)
La pondération est la suivante:
50% pour la partie 1 du cours
50% pour la partie 2 du cours
Langue(s) d'évaluation
- français